Дифференциальная диагностика в традиционной китайской медицине основана на тщательном анализе и синтезе данных, полученных с помощью четырех методов диагностики и служит инструментом для понимания природы заболевания, внутренних взаимоотношений ЦЗАН-ФУ-органов, силы защитной ЧИ и патогенного фактора и динамики патологического процесса.
Дифференциальная диагностика является основой для последующего лечения, причем по ходу заболевания изменяется состояние пациента и патогенного фактора, что обязательно учитывается и накладывает отпечаток на последующее лечение. Так, в трактате "Люй Ши Чунь Цю" сказано: "Поколения сменяются, время идет, необходимо менять и законы. Сравним это, для примера, с хорошим врачом. Болезни многократно меняются, соответственно и врач многократно меняет лекарства. Если же болезнь изменилась, а лекарства меняться не будут, то люди, жившие некогда многие годы, ныне станут умирать несовершеннолетними..."
В традиционной китайской медицине существует целый ряд способов дифференцировки синдромов, такие, как дифференцировка по "Восьми Принципам", по теории о ЧИ и крови, ЦЗАН-ФУ органах, каналах и коллатералях. Главной среди них является дифференцировка по "Восьми Принципам". Дифференцировка по теории о ЧИ и крови и по ЦЗАН-ФУ органам применяется в основном для эндогенных заболеваний, а дифференцировка по каналам и коллатералям используется для распознавания расстройств в каналах и коллатералях. Каждый способ дифференциальной диагностики имеет свои специфичные черты и в то же время дополняет другие. Поэтому необходимо применение и осмысливание каждого метода исходя из клинической ситуации.